苏丹正处于快速的城市化进程中：城市居民的比重已经从1990年的27%上升到了2006年的42%（世界卫生组织/联合国儿童基金会，2008）。据估计，家庭用水的消耗量在11亿立方米左右。城市居民区的安全供水与卫生设施的覆盖程度较高。2006年，可获得安全供水的城市居民的比率是78%，在乡村地区，这一比率是64%。在能够获取使用健康设施方面，城乡之间的差距更加明显，分别是城市50%和乡村24%（世界卫生组织/联合国儿童基金会，2008）。因此，与水相关的一些传染疾病，尤其是在北方地区，疟疾和腹泻这两种疾病的发病率很高，这一状况又因为营养不良现象的广泛存在而加剧。疟疾是一种流行病：苏丹全国75%的人口面临感染此疾病的危险（世界卫生组织，2008a）。2007年一年之中，全国共计报告疟疾感染病例270万例，因罹患疟疾而死亡的病例占到医院所有死亡病例的6%以上（世界卫生组织/2008b）。

　　家庭，农业和工业产业排放的污染物，对淡水资源的水质造成了严重的影响。在许多地区，比方说苏丹的南部和西部，地下水的水位就在地面以下数米，卫生设施的运作（主要是现场处理系统，例如化粪池和蹲坑厕所等）以及城市废物的不当处理都对地下水源带来了化学和细菌的污染。几乎所有的污水井和蹲坑厕所都和地下水层相连，而它们往往距提供饮用水的水井只有10到20米远。

　　得益于尼罗河及其支流，苏丹的水电潜力达90亿瓦，开发其中的50亿瓦在经济上是行得通的。但是目前，现有的四座多用途水坝的发电量仅为3.35亿瓦。2004年，苏丹全国的发电量（包括火电和水电在内）共计有12亿瓦，这些电量还没有满足需求，而且在实际中，这些电量还大大超出了苏丹有限的电力分配能力。造成苏丹灌溉系统发展的主要障碍就是其现有水坝的储水能力低下。此外，由于沉积作用，水坝的储水能力也比设计储水能力的91亿立方米降低了三分之一。提高水库的蓄水能力对于保障粮食安全是极其重要的，因为尼罗河全年总流量的85%是在7月份到9月份之间发生的，而在其他的时间，尼罗河的流量是很低的，尤其是在青尼罗州，其灌溉面积占到农业种植面积的70%。

　　尼罗河及其支流一直用做航运运输。目前，大约只有1700公里的水路在使用中，但是这种状况也许会被彻底改善。直到1977年，苏丹河运公司还拥有非洲最大的舰队，但是持续的退化使得舰队的数量减少到之前的十分之一（2005）。水路运输不再被优先考虑，运输服务也只是在南北方之间提供，而且水运从没有大规模地发展到苏丹的其他地方。此外，各地方当局之间缺少协调也是阻碍水路运输发展的障碍之一，在修建水坝和桥梁的时候，往往忽略了航运的需要。