我部于2002年7月通过科技部向日本政府提出了合作开展"中国水权制度建设研究项目"的申请。2004年3月8日，我部与日本国际协力机构（以下简称JICA）在京签定了关于中日两国政府合作"中华人民共和国水权制度建设研究项目"的会谈纪要和实施细则，标志着项目进入实施阶段。

　　本项目的主要目的是通过国际合作，学习借鉴国外先进的水权水市场运行和管理经验，推进我国水权水市场的制度建设，实现我国水资源的合理配置和节水型社会的建设。

　　项目执行期确定为3年，分两阶段实施，第一阶段主要是引进日本等国家在水权制度建设方面的经验，对试点地区进行调查并制定水资源管理基本规划和水资源分配计划，研究建立试点地区的水权制度政策框架；第二阶段主要是在试点地区进行水权制度建设的时间，在总结经验的基础上建立全国范围的水权制度建设框架。

　　我部对此项目非常重视，专门成立了项目指导委员会和项目办公室，指导委员会由翟浩辉副部长担任主任，国科司、规划计划司、政策法规司、水资源司、外资办、松辽委和辽宁省水利厅为成员单位，负责协调解决项目的重大问题；项目办公室设在水利部外资办公室，负责项目的日常管理工作；辽宁水利厅负责太子河流域试点研究的工作。

　　日方JICA负责项目的执行与管理，并由熟悉水权制度的大学教授、政府官员和咨询专家等组成日本政策咨询专家组，负责介绍日本和其他国家水权制度的相关经验；由国土交通省职员组成日本国内支援委员会，负责为JICA提供建议；工营公司作为咨询单位负责项目的研究工作。